GA-P35-DS3P (rev. 2.0).
 

Кулер процессора стартует с задержкой примерно 10-15 сек, из-за чего это может быть?

Может из-за температуры процессора.

Процессор Intel Core 2 Duo E6750, кулер GlacialTech Igloo 5063 (Al, 3200rpm, 32dBA) ,температура в biose 38C сразу после старта ПК.

Это нормально. В начале температура CPU ниже той, при которой стартует кулер. Советую не обращать внимания, это интеллектуальное управление кулерами в работе.

Если мне не изменяет память, на интелях боксовый кулер с ШИМ стартует при 26C. Как ведут себя кулеры сторонних производителей не в курсе.

Решено, в биосе стояло CPU Smart FAN Control - Enable.

Это правильно и disable ставить не надо! Как вам сказали, данное поведение кулера на системных платах Gigabyte нового поколения - это нормально.