выключаются неиспользуемые HDD
 

система имеет три диска, останавливаются после некоторого времени неиспользования 2,3 где файлы. а потом долго раскручиваются, энергопотребление стоит: "никогда не останавливать"! что может быть?

Т.е. здесь? http://forum.oszone.net/post-1100496.html#post1100496

Они случайно не определяются как съёмные?
Выполните пункт 4.4 правил форума.

Посмотрите в Биос аналогичные настройки.