пользователь system32
 

Windows server 2003
вот обнаружил у себя в Active Directory пользователя system32. Он входит во многие группы-built-in + созданные группы.
Заметил, что им, кто-то заходил по терминалу!
Сейчас хочу или удалить его, или отключить, или заменить пароль.
Повлияет ли это на работу самой ОС ?

system может быть, но не в терминале, а так - похоже, прикалывается кто-то. Отключайте.