Например, так:
Код:
@echo off
if exist %temp%\dirs.txt erase %temp%\dirs.txt
for /r %%i in (.) do echo %%i >> %temp%\dirs.txt
for /f %%d in ('findstr /r /c:".*\\~[^\\]*\\\." %temp%\dirs.txt') do rd /s /q %%d
не самое изящное решение - сбрасывает во временный файл список всех подкаталогов, но как-то невнятно findstr с консолью работает
