YikxX, из этой статьи?
Сжатые файлы и ModifyPE
Вроде там все понятно написано.
Большинство файлов проходят двойную проверку: при копировании проверяется контрольная сумма, а потом (в ходе установки) еще и цифровая подпись.
При несовпадении контрольной суммы файл вообще не скопируется (для этого и нужна Modifype). А без цифровой подписи - скопируется, но в логе будет ошибка. Можно пропатчить Sfcfiles.dll, и ошибки не будет:
Патч SfcFiles.dll