Rogalik
1. Вам нужно сначала выяснить, каким образом работают аддоны. Я подозреваю, что большинство из них ничего общего с RunOnceEx не имеет. Но для страховки назначьте 9999
2. Run - будет запускаться каждый раз, при входе любого пользователя в систему. RunOnceЕх - однажды.
3. Мне кажется, вы путаетесь в разделах реестра. Статью прочтите:
Твики реестра.