[gults]

А chkdsk под Windows не пробовали запускать? Попробуйте chkdsk e: /f.
Какой объем у первого жесткого диска и физически диск E: какой по расположнию, 2й или 3й ?
У FAT32 разделов бывает ситуация, когда повреждается первая копия FAT таблицы, после чего Windows, и все стандартные утилиты проверок ничего плохого не находят, но работать с разделом невозможно. Чтоб вытащить инфу правил загрузочный сектор, делая вторую копию FAT первой и единственной. Этого хватало, чтоб прочитать файлы. По идее можно было бы проверить это. Ситуация похожая. Но имееся ли какой-нибудь софт для решения данной задачи, не знаю. Как вариант можно было бы скопировать 2ю FAT поверх первой, предварительно сохранив копию первой...