Ладно, отвечу сам на свой вопрос. Для того чтобы при первом входе юзера в систему не появлялось меню Пуск, нужно импортировать в реестр вот эти два параметра.
Код:

[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced]
"StartButtonBalloonTip"=dword:00000002
"StartMenuInit"=dword:00000002