[kim-aa]

1) А в диспечере задач отоброжение режима ядра включено? (Красные линии на графике производительности есть?).
2) А сама дефрагментация давно проводилась? (Может файлы сильно "размазаны" по винчестеру).
3) А сетевая карта какая? Скажем при одинаковой bandwith Intel будет использовать 5% времени ядра (из-за частичной аппаратной акселерации и более "вылизанных"драйверах), а Realtek все 60-70%.
4) А на время копирования неплохо бы антивирус отключить на пробу.
5) Это определенно не активное сетевое оборудование и не СКС, т.к. у Вас хорошие показатели при копировании по сети используя SMB (Win).
6) Проверить сетевую карту можно копируя на локальной машине с винчестера на винчестер, однако задействуя как источник сетевой путь, а не дисковый.
Таким способом Вы частично задействуете сетевой стек, но не будете использовать драйвер сетевой карты и ее саму.