Можно попробовать такой утилиткой как EasyRecovery(если память не изменяте, то она должна заниматься и дискетками) ...
А вообще следует брать те утилиты, которые работают с флопиком на физическом уровне, при этом использовали как можно меньше функций ОС при доступе к дискетке...
Если вспомнить про сьемки кино и про дубли, то можно повторить эту операцию ... Еще раз перенести файлы... Думаю проблем будет намного меньше
