[Prisoner]

*) Зависит от решения программиста.
1) Координаты лучше задавать относительно и проектировать скрипт таким образом чтобы о координатах заботился броузер. В этом случае поможет относительное позицирование. Лучше всего будет взять готовую менюшку и поковыряться в коде.
2) Можно как создавать новый объект (слой, скажем), так и скрывать/показывать созданный на каком-то этапе (загрузка страницы) объект, а можно держать один объект и выводить в него содержимое некой структуры (массива к примеру). Лично мне кажется наиболее удобным способ скрыть/показать заранее сляпанный слой.