[FrIcE]

Во первых, нужно проверить, что загрузчик видит библиотеку: ldconfig -r | grep pcre.
Если она видна, значит приложение не учитывает дополнительные пути расположения библиотек. Лечится установкой LDFLAGS="-L/usr/local/lib" перед запуском configure либо можно поправить Makefile.
Если она не видна, значит не прописаны дополнительные пути загрузчика, нужно их добавить: ldconfig -m /usr/local/lib и затем проверяем, видит ли загрузчик библиотеку (должен видеть). Если видит, пробуем продолжить компиляцию, либо шаманим с LDFLAGS.

Чтобы загрузчик при запуска ОС учитывал дополнительные пути расположения библиотек, нужно прописать в rc.conf:
ldconfig_paths="/usr/local/lib /other/path ..." (по умолчанию насколько я помню он подгружает только /lib и /usr/lib).