(Простите, я не понимаю почему вы крон, запущенный из под рута, зовёте юзерским)
Задача добавить в крон скрипт чистящий времянки созданные приложением запущенным из под рута. Думаю крон мне потребуется именно рутовый, что бы скрипт имел право на удаление.
Код:

drwx------ 2 root root 4096 Jan 15 11:27 template9171817451544848430
drwx------ 2 root root 4096 Jan 27 09:12 template9172310449941554954
drwx------ 2 root root 4096 Jan 26 00:34 template9173399062074210944
drwx------ 2 root root 4096 Jan 23 11:48 template9173633267853307291
drwx------ 2 root root 4096 Jan 15 13:56 template9173980295875671126
drwx------ 2 root root 4096 Jan 12 00:17 template9175074460009516576
drwx------ 2 root root 4096 Jan 22 17:10 template9175118386539401713