saneck,
Можете использовать стороннее ПО, типа
USB Safely Remove
Так же можете в настройке USB устройства сделать так:

И спокойно извлекать его напрямую.
И последнее, сделайте чистую загрузку системы -
Как выполнить «чистую» загрузку. И посмотрите, активен ли пункт безопасного извлечения сейчас.
Мне кажется, какое-то ПО обращается к вашему USB и поэтому пункт безопасного извлечения неактивен.