DonQuixote
В SourceTagFile укажите полный путь, только без буквы диска, к маркерному файлу, этот файл должен находиться на том же диске, где и ваш софт. Все, теперь корень вашего диска определен, далее в CommandN указываем путь к файлу от корня диска.
В Folder свои переменные создавать нельзя, можно указывать только существующие, например:
Код:

Folder=%ROOT%\softSV\Текст\PDF\PDF-XChange Viewer\pro 5.0.265
Command1=PDF-XChange2012Pro 5.0.265.exe /qb
Код:

Command1=softSV\Текст\PDF\PDF-XChange Viewer\pro 5.0.265\PDF-XChange2012Pro 5.0.265.exe /qb
- то же самое.
Мой вариант выше актуален, только укажите правильный путь к SourceTagFile и отметь нужный вам вариант параметр
Check* (на каком носителе все это дело лежит).