Можно сами вертушки поменять на малошумные, можно имеющиеся через резистор подключить...
Чтобы "автоматически регулировалась" можно купить вентиляторы с датчиками температуры.
Тема очень обширная, штудируйте темы форума
Разгон, охлаждение и моддинг.