Похожая проблема, происходит на DC который же и есть глобальынй каталог.
Код:

Active Directory не удается подключиться к глобальному каталогу.
Дополнительные данные
Значение ошибки:
1355 Указанный домен не существует или к нему невозможно подключиться.
Внутренний ID:
3200cf3
Действие пользователя:
Убедитесь, что глобальный каталог находится в лесу и доступен для контроллера домена. Для диагностики можно использовать программу NLTEST.
Еще по непонятным мне причинам происходят попытки репликации с другими дочерними филиалами, когда в топологии репликации указаны всего 2 сервера. 1 главный сервер филиала и главный сервер предприятия.
VUGGMAIN никак не должен реплицироваться. В сайтах и службах указаны 2 сервера. Хотя были моменты когда по таинственным причинам там автоматически добавлялись сервера с которыми не должны проходить репликации, почему мне не понятно.
DCIAG
Domain Controller Diagnosis
Performing initial setup:
Done gathering initial info.
Doing initial required tests
Testing server: OuggExt\OUGGEXT
Starting test: Connectivity
......................... OUGGEXT passed test Connectivity
Doing primary tests
Testing server: OuggExt\OUGGEXT
Starting test: Replications
REPLICATION-RECEIVED LATENCY WARNING
OUGGEXT: Current time is 2010-11-07 09:56:42.
DC=ForestDnsZones,DC=zapgaz,DC=net
Last replication recieved from
VUGGMAIN at 2010-11-06 19:04:35.
CN=Schema,CN=Configuration,DC=zapgaz,DC=net
Last replication recieved from
VUGGMAIN at 2010-11-06 19:02:25.
CN=Configuration,DC=zapgaz,DC=net
Last replication recieved from
VUGGMAIN at 2010-11-06 19:00:22.
DC=vugg,DC=zapgaz,DC=net
Last replication recieved from
VUGGMAIN at 2010-11-06 19:04:48.
......................... OUGGEXT passed test Replications
Starting test: NCSecDesc
......................... OUGGEXT passed test NCSecDesc
Starting test: NetLogons
......................... OUGGEXT passed test NetLogons
Starting test: Advertising
......................... OUGGEXT passed test Advertising
Starting test: KnowsOfRoleHolders
......................... OUGGEXT passed test KnowsOfRoleHolders
- Происходит довольно таки долго, порядка 10-20 сек.
Starting test: RidManager
......................... OUGGEXT passed test RidManager
Starting test: MachineAccount
......................... OUGGEXT passed test MachineAccount
Starting test: Services
......................... OUGGEXT passed test Services
Starting test: ObjectsReplicated
......................... OUGGEXT passed test ObjectsReplicated
Starting test: frssysvol
......................... OUGGEXT passed test frssysvol
Starting test: frsevent
......................... OUGGEXT passed test frsevent
Starting test: kccevent
......................... OUGGEXT passed test kccevent
Starting test: systemlog
......................... OUGGEXT passed test systemlog
Starting test: VerifyReferences
......................... OUGGEXT passed test VerifyReferences
Running partition tests on : DomainDnsZones
Starting test: CrossRefValidation
......................... DomainDnsZones passed test CrossRefValidation
Starting test: CheckSDRefDom
......................... DomainDnsZones passed test CheckSDRefDom
Running partition tests on : ForestDnsZones
Starting test: CrossRefValidation
......................... ForestDnsZones passed test CrossRefValidation
Starting test: CheckSDRefDom
......................... ForestDnsZones passed test CheckSDRefDom
Running partition tests on : ougg
Starting test: CrossRefValidation
......................... ougg passed test CrossRefValidation
Starting test: CheckSDRefDom
......................... ougg passed test CheckSDRefDom
Running partition tests on : Schema
Starting test: CrossRefValidation
......................... Schema passed test CrossRefValidation
Starting test: CheckSDRefDom
......................... Schema passed test CheckSDRefDom
Running partition tests on : Configuration
Starting test: CrossRefValidation
......................... Configuration passed test CrossRefValidation
Starting test: CheckSDRefDom
......................... Configuration passed test CheckSDRefDom
Running enterprise tests on : zapgaz.net
Starting test: Intersite
......................... zapgaz.net passed test Intersite
Starting test: FsmoCheck
......................... zapgaz.net passed test FsmoCheck
При том что DCDIAG проходит, постоянно сыпятся ошибки ...
Код:

В ходе проверки согласованности знаний обнаружено, что все попытки установки связи репликации со следующим контроллером домена завершились неудачно.
Попыток:
5
Контроллер домена:
CN=NTDS Settings,CN=SRV1,CN=Servers,CN=Zapgaz,CN=Sites,CN=Configuration,DC=zapgaz,DC=net
Интервал (мин):
124
Объект подключения для этого контроллера домена будет проигнорирован, а для гарантии продолжения репликации будет установлено новое временное подключение. Как только репликация с этим контроллером домена возобновится, временное подключение будет удалено.
Дополнительные данные
Значение ошибки:
1908 Не удается найти контроллер этого домена.
Код:

Попытка установки связи репликации для следующего раздела каталога, доступного для изменения, завершилась ошибкой.
Раздел каталога:
DC=ForestDnsZones,DC=zapgaz,DC=net
Исходный контроллер домена:
CN=NTDS Settings,CN=SRV1,CN=Servers,CN=Zapgaz,CN=Sites,CN=Configuration,DC=zapgaz,DC=net
Адрес исходного контроллера домена:
a6c9ec63-67ab-4ba6-800d-672bad3aaa59._msdcs.zapgaz.net
Межсайтовый транспорт (если существует):
CN=IP,CN=Inter-Site Transports,CN=Sites,CN=Configuration,DC=zapgaz,DC=net
До устранения этой ошибки выполнение репликации между данным и исходным контроллерами домена будет невозможно.
Действие пользователя
Проверьте доступность исходного контроллера домена и работоспособность сетевого подключения.
Дополнительные данные
Значение ошибки:
1908 Не удается найти контроллер этого домена.
И далее ошибки репликации с филиалами которых нет в топологии репликации...
Код:

Попытка установки связи репликации для следующего раздела каталога, доступного только для чтения, со следующими параметрами завершилась ошибкой.
Раздел каталога:
DC=tugg,DC=zapgaz,DC=net
Исходный контроллер домена:
CN=NTDS Settings,CN=SRV1,CN=Servers,CN=Zapgaz,CN=Sites,CN=Configuration,DC=zapgaz,DC=net
Адрес исходного контроллера домена:
a6c9ec63-67ab-4ba6-800d-672bad3aaa59._msdcs.zapgaz.net
Межсайтовый транспорт (если существует):
CN=IP,CN=Inter-Site Transports,CN=Sites,CN=Configuration,DC=zapgaz,DC=net
Дополнительные данные
Значение ошибки:
1908 Не удается найти контроллер этого домена.
Сервер доступен, DNS тоже в порядке...
И для того чтобы рассеять сомнения -
Код:

Default Server: localhost
Address: 127.0.0.1
> a6c9ec63-67ab-4ba6-800d-672bad3aaa59._msdcs.zapgaz.net
Server: localhost
Address: 127.0.0.1
Non-authoritative answer:
Name: srv1.zapgaz.net
Address: 172.16.0.1
Aliases: a6c9ec63-67ab-4ba6-800d-672bad3aaa59._msdcs.zapgaz.net