[vadblm]

NTFS в целом быстрее - это заметно при копировании кучи мелких файлов, при копировании одного большого - без разницы, экономнее - опять же заметно при куче мелких файлов - размер кластера 4к против 8к, надёжнее - это журналируемая ФС, спокойней переносит некорректное извлечение - меньше шанс потерять данные.

Но в последнем плюсе есть и минус - журнал даёт дополнительную нагрузку на запись, что увеличивает износ устройства. У флешек ресурс, как вы знаете, далеко не резиновый.

Ещё у FAT32 есть ограничение на размер файла - 4Гб.

Что вам важнее, долговечность или удобство - решайте сами.