[kotkovets]

Lisabon ,что вам мешает в функции .onInit менять значение $INSTDIR в зависимости от переменной
$R0 ???

читать дальше »

Код:

Function .onInit
 !insertmacro IsUserAdmin $R0
 ; с правами администратора
 ${If} $R0 == 1
  StrCpy $INSTDIR "$PROGRAMFILES\Программа"
  MessageBox MB_OK "$INSTDIR"
 ${EndIf}
; c ограниченной учеткой
 ${If} $R0 == 0
  StrCpy $SYSDRIVE $WINDIR 2
  StrCpy $INSTDIR "$SYSDRIVE\Программа"
  MessageBox MB_OK "$INSTDIR"
 ${EndIf}
FunctionEnd