andreton, в задаче не оговорен поиск в подкаталогах, кодировка и размер файлов
VBS-вариант для поиска в подкаталогах и файлов размером много меньше RAM:
Код:

Set objFSO = CreateObject("Scripting.FileSystemObject")
Set objRegEx = CreateObject("VBScript.RegExp")
objRegEx.Pattern = "(?:(^)[\n\r]+|(\r?\n)[\n\r]*)"
objRegEx.IgnoreCase = True
objRegEx.Global = True
'-----------------------------
FileProcByExt "C:\TEST", "TXT"
'-----------------------------
Sub FileProcByExt (strDir, strExt)
Dim oS, cS, oI, cF
Set oS = objFSO.GetFolder(strDir)
Set cS = oS.SubFolders
On Error Resume Next
For Each oI In cS
FileProcByExt oI.Path, strExt
Next
Set cF = oS.Files
For Each oI In cF
If StrComp(objFSO.GetExtensionName(oI.Path),strExt,1)=0 Then FileProc oI.Path
Next
End Sub
Sub FileProc (strFile)
Dim oF, sF
Set oF = objFSO.OpenTextFile(strFile, 1)
If oF.AtEndOfStream Then Exit Sub
sF = oF.ReadAll
oF.Close
sF = objRegEx.Replace(sF, "$1$2")
Set oF = objFSO.OpenTextFile(strFile, 2)
oF.Write(sF)
oF.Close
End Sub
P.S. всё-таки специализированные консольные утилиты сделают это быстрее