[Ferum01]

так наверное проще всего
for(r = 0; r < NR; r++)
fscanf(f,"%f %f %f\n", weather[r][0], weather[r][1], weather[r][2]);

если данные всегда вида:
23.4 55.2 34.5
54.4 35.6 79.8
45.9 65.8 76.7
23.1 45.2 56.3
34.4 98.5 56.6
12.3 23.2 34.1
98.4 87.3 76.2