ОС вообще надо указывать.... Дефрагментацию и проверку на ошибки дисков давно делали? Если с этой стороны все впорядке - зайдите в Диспетчер устройств и проверьте режим работы ATA/ATAPI контроллеров (должен быть DMA), а в Дисковых устройствах в Политиках разрешите кэширование и включите повышенную производительность.