samurai, чем диски пишете? Многие программы для записи дисков умеют сами записывать Audio-CD из файлов FLAC. Попробуйте.
Другой способ: скачать
FLAC с графической оболочкой, добавить файлы FLAC в окно и нажать Decode.
Потом полученные файлы WAV записать на болванку в режиме CDDA.