garik404, Варианты:
Подключите винчестер к другому компьютеру и проверьте различными антивирусами (напр. cureit, МВАМ и др. - см. в подписи). Сделайте загрузочный CD (WinPE, BartPE и пр.) и проверьте cureit (можно предварительно распаковать например на флешку и запустить _start.exe)
Дополнительно
KAV RescueDisk
Avira Antivir RescueCD
Можете подключить реестр как куст или воспользоваться
ERD Commander и посмотреть ветки реестра
HKEY_CURRENT_USER\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run
HKEY_USERS\.DEFAULT\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run
HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\System
HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\System
HKLM\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\policies\Explorer
Рекомендую ознакомиться с описанием
Viruslist.com - Trojan.Win32.Krotten.l
И
Если что-то отключено — wiki.drweb.com - Если не запускаются программы.
