[Petya V4sechkin]

vlad20, удалите параметры ClearRecentDocsOnExit, NoRecentDocsHistory и NoInstrumentation (если есть) в разделах реестра:

• HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer
• HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\policies\Explorer

и перезагрузитесь.

[vlad20]

таких параметров нет, ни для конфигурация пользователя, ни для конфигурация компьютера

[Petya V4sechkin]

vlad20, на меню Пуск правой кнопкой мыши -> Свойства -> вкладка Меню "Пуск" -> кнопка Настроить -> вкладка Дополнительно -> флажок "Отображать список недавно использовавшихся документов" стоит?

[vlad20]

по указанному пути "флажка" нет

[Petya V4sechkin]

vlad20, есть:

[vlad20]

возможность установить "флажок" есть, но самого "флажка" нет, не установлено значение для сохранения списка недавно использовавшихся док-тов, в моём случае, установка "флажка", разве исправит ситуацию с

после перезагрузки очищается история IE, история команд в диалоговом окне Выполнить »

[Petya V4sechkin]

vlad20, в разделе реестра
HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\RunMRU
параметры появляются при использовании "Выполнить"?

[vlad20]

нет, ни каких параметров нет(в разрешениях у пользователя на RunMRU полный доступ), хотя в "Выполнить" команды присутствуют, но стоит перезагрузить компьютер и они пропадут из Выполнить, как и история IE и, как оказалось история flash

[Petya V4sechkin]

vlad20, в безопасном режиме так же?
Под другой учетной записью так же?

ни каких параметров нет

Выложите лог Process Monitor при выполнении cmd.exe (меню File -> Save -> PML-формат) в архиве на любой файлообменник.